Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TdgP56581 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TdgP56581 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TdgP56581 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TdgP56581 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TdgP56581 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TdgP56581 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms