Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lim2P56563 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lim2P56563 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms