Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtskP55097 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtskP55097 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtskP55097 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms