Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms