Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp1P52624 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms