Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec1P51908 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms