Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx3P50481 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms