Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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BckdhaP50136 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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BckdhaP50136 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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BckdhaP50136 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BckdhaP50136 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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