Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Resp18P47939 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms