Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gli1P47806 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gli1P47806 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gli1P47806 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms