Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms