Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sipa1P46062 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms