Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms