Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LtbP41155 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbP41155 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbP41155 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LtbP41155 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LtbP41155 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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