Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf2P39429 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Traf2P39429 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms