Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf1P39428 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf1P39428 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf1P39428 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms