Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprkP35822 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprkP35822 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprkP35822 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtprkP35822 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms