Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ddit3P35639 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms