Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6dP35459 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6dP35459 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms