Protein–RNA interactions for Protein: P32240

Ptger4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger4P32240 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptger4P32240 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptger4P32240 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms