Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DesP31001 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DesP31001 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DesP31001 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DesP31001 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DesP31001 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DesP31001 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DesP31001 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DesP31001 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DesP31001 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DesP31001 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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