Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Defa3P28310 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa3P28310 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms