Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lef1P27782 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lef1P27782 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Lef1P27782 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lef1P27782 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms