Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CftrP26361 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CftrP26361 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CftrP26361 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CftrP26361 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CftrP26361 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CftrP26361 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CftrP26361 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CftrP26361 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CftrP26361 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CftrP26361 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CftrP26361 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CftrP26361 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms