Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms