Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sptan1P16546 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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