Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Srp54P14576 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srp54P14576 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms