Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vpreb1P13372 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms