Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lamp1P11438 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lamp1P11438 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms