Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P10404 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P10404 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P10404 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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