Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CatspereP0DP43 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms