Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TnfP06804 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TnfP06804 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TnfP06804 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TnfP06804 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TnfP06804 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms