Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Me1P06801 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Me1P06801 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Me1P06801 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Me1P06801 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms