Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01810 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01810 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01810 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01810 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01810 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01810 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms