Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01653 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01653 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01653 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01653 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01653 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01653 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms