Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01649 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01649 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01649 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01649 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01649 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01649 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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P01649 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01649 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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P01649 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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P01649 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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P01649 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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P01649 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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P01649 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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P01649 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P01649 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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