Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ShdO88834 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ShdO88834 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ShdO88834 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ShdO88834 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ShdO88834 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ShdO88834 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ShdO88834 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ShdO88834 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ShdO88834 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ShdO88834 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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