Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Dnmt3bO88509 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3bO88509 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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