Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChkbO55229 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ChkbO55229 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms