Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Copb2O55029 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Copb2O55029 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms