Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atp10aO54827 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp10aO54827 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms