Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DffbO54788 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
DffbO54788 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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DffbO54788 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
DffbO54788 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DffbO54788 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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