Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CaluO35887 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CaluO35887 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CaluO35887 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CaluO35887 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms