Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms