Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Prrt1O35449 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Prrt1O35449 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prrt1O35449 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prrt1O35449 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Prrt1O35449 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt1O35449 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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