Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xbp1O35426 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xbp1O35426 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Xbp1O35426 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xbp1O35426 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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