Protein–RNA interactions for Protein: O35310

Hs3st1, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st1O35310 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hs3st1O35310 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hs3st1O35310 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms