Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bhlhe40O35185 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms