Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms