Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gcm2O09102 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gcm2O09102 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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